Sau ba năm khi mà phần một của bộ anime này kết thúc thì một lần nữa Studios: Arms cũng đã khiến cho khán giả bất ngờ khi cho trình làng phần thứ hai của bộ anime với thể loại ecchi, hài hước, hành động này. Trong phần thứ hai này thì phim gồm tất cả 12 tập phim và cũng chính thức được phát sóng từ tháng 4 cho đến tháng 6 năm 2013 là kết thúc, ngoài ra thì phần hai của phim cũng được lấy tên gọi chính là Hyakka Ryouran: Samurai Bride hoặc Hyakka Ryouran: Samurai Girls 2nd Season, Hyakka Ryouran: Samurai Girls Dai 2-ki.
Cốt truyện trong phim Những Cô Gái Samurai Phần 2 xoay quanh về một Trường Học thuật Buou, đó chính là một học viện nằm ở chân núi Phú Sĩ và cũng là nơi con cái của các gia đình quân nhân được đào tạo để trở thành chiến binh samurai giỏi nhất. Học viện đang ở giữa cuộc tranh giành quyền lực giữa Yukimura Sanada và Matabei Goto của phe Toyotomi và hội học sinh quyền lực cai trị trường, và Muneakira Yagyu, chủ sở hữu của Yagyu Dojo, và Jubei Yagyu bí ẩn bị kéo vào cuộc chiến giữa cuộc xung đột. Cùng đón xem phần thứ hai của bộ anime này để theo dõi nhé các bạn.