Cốt truyện Trường Trung Học Rồng xoay quanh về nhân vật chính có tên là Hyoudou Issei, bản thân anh được biết đến là một nam sinh trung học năm hai, tuy nhiên số phận anh ta khá là đen đủi khi mà anh đã bị giết ngay trong ngày đầu hẹn hò bởi một thiên thần sa ngã, nhưng sau đó được hồi sinh bởi Rias Gremory vì thế anh đồng ý tham gia vào nhóm của cô và từ đó anh bắt đầu có cuộc sống mới của mình. Và được biết rằng Issei cũng chính là vật chủ của Ddraig (rồng đỏ và biệt danh là Welsh Dragon), một trong những sinh vật mà cả ba thế giới đều sợ với sức mạnh mà họ đã thụy uy trước đó.

Sau khi được hồi sinh thì giờ đây cũng là lúc mà anh có thể sử dụng sức mạnh của rồng để chiến đấu bảo vệ cho Gremory cũng như những người mà anh yêu mến. Thời gian sau, Gremory và các thành viên nữ khác trong nhóm bắt đầu nảy sinh tình cảm với Issei, từ đó mà câu chuyện xủa Issei xoay quanh những cô nàng này cũng bắt đầu được diễn ra theo một kịch bản đầy thú vị.